Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX41Q9UJV9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX41Q9UJV9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms