Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA1Q9UIW2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms