Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms