Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms