Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNRD1Q9P1U0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms