Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms