Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC10Q9NYD6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms