Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3EQ9NVU0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms