Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms