Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L1Q9NU39 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms