Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS45Q9NRW7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms