Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms