Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms