Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO4Q9NRQ5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms