Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF4ENIF1Q9NRA8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4ENIF1Q9NRA8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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