Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms