Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRIP3Q9NQ35 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms