Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms