Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms