Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR88Q9GZN0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms