Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZYG11BQ9C0D3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms