Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP4Q9C0A0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms