Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms