Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCGF6Q9BYE7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms