Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRRTQ9BXP5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms