Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms