Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms