Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
RTKNQ9BST9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms