Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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