Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms