Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms