Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms