Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF607Q96SK3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms