Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
CCT8L2Q96SF2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms