Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGS1Q96RS0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms