Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms