Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms