Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX22Q96L94 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms