Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGBD1Q96JS3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms