Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms