Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCMH1Q96GD3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms