Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTV1Q96GA3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms