Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms