Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EAF2Q96CJ1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EAF2Q96CJ1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms