Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM52Q96A61 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms