Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB13Q92826 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms