Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPDL3BQ92485 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3BQ92485 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms