Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM41Q8WV44 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM41Q8WV44 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms