Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG8Q8ND04 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG8Q8ND04 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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