Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00116Q8NCU8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00116Q8NCU8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms